Khi Ba Lan bị Wehrmacht xâm lược năm 1939, ông trốn sang Angers, Pháp, nơi Chính phủ Ba Lan lưu vong được thành lập. Ông sống tại Château de Pignerolle gần đó từ ngày 2 tháng 12 năm 1939 cho đến khi chuyển đến London vào ngày 10 tháng 6 năm 1940, nơi ông tham gia chính phủ Ba Lan lưu vong cùng các Tướng Władysław Sikorski và Stanisław Mikołajczyk. Ông là người phản đối thỏa thuận Sikorski-Mayski.

Tháng 2 năm 1945, Joseph Stalin, Winston Churchill và Franklin D. Roosevelt tổ chức Hội nghị Yalta. Tương lai của Ba Lan là một trong những chủ đề chính được thảo luận. Stalin tuyên bố rằng chỉ một chính phủ mạnh, thân Liên Xô ở Ba Lan mới có thể đảm bảo an ninh cho Liên Xô. Kết quả của hội nghị, các nước Đồng minh đồng ý rút lại việc công nhận Chính phủ Ba Lan lưu vong, sau khi thành lập một chính phủ mới trên lãnh thổ Ba Lan.

Raczkiewicz chết khi sống lưu vong vào năm 1947, tại thị trấn Ruthin của xứ Wales.[1] Ông được chôn cất tại nghĩa trang tại Newark-on-Trent ở Anh.